Nissenius blev gift med Karen Bonnesen den 7 maj 1913. Karen blev født den 7 aug. 1891; døde i 1984. [Gruppeskema] [Familietavle]
Johan blev gift med Emma Nora Høegh-Guldberg den 6 feb. 1873. Emma blev født den 25 feb. 1848; døde den 27 apr. 1910. [Gruppeskema] [Familietavle]
Nissenius blev gift med Doris Margrethe Jensen den 20 nov. 1841. Doris blev født den 4 jun. 1809; døde i 1897. [Gruppeskema] [Familietavle]